Aktywność tej misji przejawia się w organizowaniu świąt biblijnych (Szawuot, Pascha, Rosz HaSzana, Jom Kippur, Chanuka, Sukkot), spotkań edukacyjnych z wykładami nt. starożytnego i współczesnego Izraela oraz historii narodu żydowskiego.

Seminaria mające na celu pogłębienie znajomości Starego Testamentu i przybliżenie wiedzy o tematyce judeo-chrześcijańskiej często połączone są z wystawami zdjęć z albumu „Fascynujący Izrael” Wydawnictwa „Koinonia”, organizowanymi w różnych miastach Polski.

Celem Misji Polska-Izrael jest propagowanie postaw otwartości, tolerancji i szacunku wobec żydowskiej grupy etnicznej, działania na rzecz pojednania między narodami: polskim i żydowskim, a także upowszechnianie wiedzy na temat ziemi ojców naszej wiary.